工作经历
2000年获北京大学生命科学学院生物化学及分子生物学系学士学位，2000-2006年硕博连读于北京大学生命科学学院并于2007年获植物学博士学位。2007-2010年在美国杜克大学基因组科学与政策研究所从事博士后研究。2010-2012年在美国国立卫生研究院(NIH)担任助理研究员(Research Fellow)。2012年受聘为复旦大学生命科学学院。
研究方向
针对中心法则中转录的三个核心环节（转录起始、延伸和终止）发展了三个高通量测序新方法，建立了转录组从头到尾的研究体系，丰富了对于基因转录这一基础分子生物学问题的认识。目前以细胞衰老和肿瘤细胞增殖为研究体系，结合高通量测序、分子生物学和生物信息学等手段研究复杂的转录组调控，特别是内含子保留和选择性多聚腺苷酸化等RNA水平调控方式的生物学功能和分子机制。在Nature、Science、Nature Methods、NAR等杂志发表近40篇SCI研究论文，成果被Nature Methods、Nature Reviews Genetics等评述。申请中美专利15项（7项获授权）。长远目标：通过研究真核生物转录组的多样性，了解高等生物复杂的基因调控网络，为深入理解人类疾病的表达机制提供理论依据。
招生专业
生物信息学
代表论文
1.Ni T#, Corcoran DL#, Rach EA, Song S, Spana EP, Gao Y, Ohler U* and Zhu J*. A paired-end sequencing strategy to map the complex landscape of transcription initiation.Nature Methods (Article), 2010; 7: 521-527
2.Ni T#*, Yang W#, Han M#, Zhang Y, Shen T, Nie H, Zhou Z, Dai Y, Yang Y, Liu P, Cui K, Zeng Z, Tian Y, Zhou B, Wei G, Zhao K, Peng W*, Zhu J*. Global intron retention mediated gene regulation during CD4+ T cell activation.Nucleic Acids Research. 2016; 44(14):6817-29
3.Ni T#*, Yang Y#, Hafez D, Yang W, Kiesewetter K, Wakabayashi Y, Ohler U, Peng W and Zhu J*. Distinct polyadenylation landscapes of diverse human tissues revealed by a modified PA-seq strategy.BMC Genomics, 2013; 14(1):615
4. Majerciak V#, Ni T#, Yang W, Meng B, Zhu J* and Zheng ZM* A viral genome landscape of RNA polyadenylation from KSHV latent to lytic Infection. PLOS Pathogens, 2013; 9(11):e1003749
5. Shen T, Li H, Song Y, Yao J, Han M, Yu M, Wei G*,Ni T*. Antisense transcription regulates the expression of sense gene via alternative polyadenylation.Protein Cell, 2017; DOI: 10.1007/s13238-017-0497-0
