工作经历
女，1986年出生于浙江宁波。2015年获得复旦大学药理学专业理学博士学位；2011年获得生物化学与分子生物学专业理学硕士学位；2008年获得暨南大学生物技术专业理学学士学位。2015年-2017年，在复旦大学生命科学学院从事博士后研究。2017年7月起被聘为复旦大学生命科学院青年副研究员。从事生物信息学、大数据、精准医学研究，具有多年肿瘤基因组学和药物基因组学相关的研究经验，擅长大数据挖掘和软件开发，作为核心成员开发了用于临床个人基因组数据解读的精准医学知识库系统PreMedKB；具有良好的生物学背景，工作积极主动，具有团队合作精神、沟通能力和科研写作经验。主持国家自然科学基金青年基金1项，参与国家重点研发计划精准医学专项、国家自然科学基金重点国际合作项目等国家级科研项目6项；已在Nature Communications、Genome Biology、Nature Biotechnology等杂志上发表相关SCI学术论文22篇，SCI总引用600多次。
研究方向
从事药物基因组学、精准医学、生物信息学等方面的研究工作。目前的主要研究方向为：利用高通量测序技术和生物信息学等手段，研究1）肿瘤发生和发展的分子机制；2）肿瘤个体化精准用药。
代表论文
1.Chen Y#, Zheng Y#, Yu Y#, Wang Y#, Huang Q#, Qian F#, Sun L#, Song Z, Chen Z, Feng J, An Y, Yang J, Su Z, Sun S, Dai F, Chen Q, Lu Q, Li P, Ling Y, Yang Z, Tang H, Shi L, Jin L, Holmes E, Ding C*, Zhu T*, Zhang Y*. (2020). Blood molecular markers associated with COVID-19 immunopathology and multi-organ damage. EMBO J 0:e105896.
2.Yu Y#, Wang Y#, Xia Z, Zhang X, Jin K, Yang J, Ren L, Zhou Z, Yu D, Qing T, Zhang C, Jin L, Zheng Y*, Guo L*, Shi L. (2019) PreMedKB: an integrated precision medicine knowledgebase for interpreting relationships between diseases, genes, variants and drugs. Nucleic Acids Research. 8;47(D1):D1090-D1101.
3.Wang J#, Yu Y#, Shen H, Qing T, Zheng Y, Li Q, Wang S, Li N, Chai R, Xu B, Liu M, Brindley JP, McManus PD, Shi L, Hu W*. (2017) Dynamic transcriptomes identify biogenic amines and insect-like hormonal regulation for mediating pairing/reproductive development in Schistosoma japonicum. Nature Communications, 8:14693.
4.Zhang W#, Yu Y#, Hertwig F#, Thierry-Mieg J#, Zhang W#, Thierry-Mieg D, Wang J, Furlanello C, Devanarayan V, Cheng J, Deng Y, Hero B, Hong H, Jia M, Li L, Lin SM, Nikolsky Y, Oberthuer A, Qing T, Su Z, …, Shi L*, Peng Z*, Fischer M*. (2015) Comparison of RNA-seq and microarray-based models for clinical endpoint prediction. Genome Biology, 25;16:133.
5.Yu Y#, Fuscoe JC#, Zhao C, Guo G, Jia M, Qing T, Bannon DI, Lancashire L, Bao W, Du T, Luo H, Su Z, Jones WD, Moland CL, Branham WS, Qian F, Ning B, Li Y, Hong H, Guo L, Mei N, …, Shi L*, Wang C*. (2014) A rat RNA-Seq transcriptomic BodyMap across 11 organs and 4 developmental stages. Nature Communications, 5, 3230.
