罗若愚副研究员,全职科研人员

   

副研究员、硕士生导师


Email:ruoyuluocs@fudan.edu.cn

 工作经历

2006年毕业于华中科技大学。在系统生物学与生物信息学领域工作了10年, 期间在代谢网络模拟, 基因调控网络重建与模拟, 系统生物学软件开发等方面开展了一些工作。基于这些工作,本人已经形成了以代谢网络、基因调控网络以及以上这两种网络相互作用动力学研究为特点的较为完整的研究体系和以最优化理论和方法以及随机动力学理论为代表的特色研究方法。以国内第一研究单位身份将有关研究成果发表在Molecular Systems Biology, PNAS 等本领域重要杂志上

 研究方向

利用物理学思想对复杂的生物代谢网络和基因调控网络进行数据的整合与建模,利用数值计算方法对复杂的模型进行高性能数值模拟和可视化,结合先进显微成像设备和多种分子生物学手段对模拟结果进行定量的验证。最终将理论分析研究与实验生物学研究结合起来,力图发现生物系统抗逆、运行及进化的普遍规律。

 获奖情况

2008年湖北省自然科学一等奖;2009年发表于PNAS的工作作为系统生物学领域的标志性成果入选中科院上海生命科学研究院成立10周年纪念册。

  招生专业

生物信息学,细胞生物学

 代表论文

1.Ruoyu Luo, HaiBin Wei, Ye Lin, KangKang Wang, Yixue Li and Yang Zhong. Photosynthetic metabolism of C3 plants shows highly cooperative regulation to maintain function under changing environmental conditions: a systems biological analysis of robustness. Proc Natl Acad Sci USA(PNAS; Vol 106, No 3, 847-852, 2009)。

2.Ruo-yu Luo, Yi-Xue Li, Qingming Luo. In reply: ‘Dynamic analysis of optimality in myocardial energy metabolism under normal and ischemic conditions’ . Molecular Systems Biology 4, Article number 208; doi:10.1038/msb.2008.38

3.Ruo-yu Luo, Sha Liao, GuanYang Tao, YuanYuan Li, ShaoQun Zeng, YiXue Li, and Qingming Luo. Dynamic analysis of optimality in myocardial metabolic networks under normal and ischemic conditions. Molecular Systems Biology msb4100071, E1-E6, 2006

4.Ruoyu Luo, Sha Liao, Shaoqun Zeng, Yixue Li, Qingming Luo. FluxExplorer: a general platform for modeling and analyses of metabolic networks based on stoichiometry. Chinese Science Bulletin Vol. 51, pp: 689-696, 2006