表型组精密测量平台简介之空间组学检测平台

空间组学是近年新兴的组学技术，在保留组织空间原位的条件下，整合转录组、蛋白组、表观组等多组学信息，系统解析生物体内分子、细胞及组织水平的空间分布与互作网络。该技术突破了传统组学缺乏空间信息的局限性，能够揭示细胞生态位特征和组织功能的空间调控机制，为理解生命过程的时空动态提供了革命性研究工具。

本平台依托于复旦大学人类表型研究院，拥有在空间组学领域一流的技术团队，在细胞生态和微环境研究、发育与疾病图谱、再生医学、以及神经、肿瘤和免疫等众多生物医学应用领域具有广阔前景，且极大地推动生命科学和医学的发展，支撑“国际人类表型组计划”和“系统生物学研究设施”等国家战略布局。

目前本平台可全面支持校内外科研团队在空间组学、基因分子表型分析、免疫表型鉴定、功能验证等领域的创新研究需求。平台配备包括空间转录组Bruker CosMx SMI、10x Genomics Xenium，空间蛋白组Akoya PhenoCycler-Fusion，功能验证平台Bigfoot全光谱超速单细胞分选仪、实时单细胞多模态分析仪、活体成像转盘共聚焦显微镜等在内的先进设备，并由经验丰富的专业技术团队负责设备运维、方法开发及实验操作，确保数据质量与实验效率。我们诚挚欢迎各科研单位前来洽谈合作，共同推进生命科学前沿研究。

平台团队已与国内顶尖医疗机构和科研单位建立了深度合作关系，包括复旦大学附属中山医院、华山医院、肿瘤医院、上海市第六人民医院等三甲医院，以及全球领先的基因组学研发机构华大基因。共同开展了多项重大临床转化医学研究，研究领域涵盖肿瘤微环境解析、疾病分子分型、组织再生机制等前沿方向，不仅产出了一批高质量的实验结果，更在精准医疗、新药研发等产业转化方面展现出巨大的市场潜力。未来，我们将继续深化产学研医协同创新，推动科研成果向临床应用转化，服务国家大健康战略需求。

01|空间组学：解码生命空间密码

空间组学是以单细胞/亚细胞精度解析生物分子（DNA、RNA、蛋白、代谢物）空间分布的新兴学科，通过高通量原位检测技术，精准定位分子在组织微环境中的空间坐标，填补了传统组学技术与宏观表型之间的空白。其核心价值在于：

◆  揭示细胞类群、功能状态及互作关系的空间异质性

◆  解析基因调控网络与组织功能的时空动态关联

◆  识别疾病状态下空间结构的异常改变（如肿瘤微环境重塑）

02|尖端设备：多维度空间解析体系

平台配备国际领先的空间多组学设备集群，构建了从分子检测到功能验证的全链条技术体系。完善的硬件基础不仅是实现高精度空间解析的前提，更是保障数据可靠性、推动临床转化研究的核心支撑。这些尖端设备通过系统化整合，可实现对同一样本的多组学层面对齐分析，为揭示生命过程的空间调控机制提供关键技术支持：

◆ Nanostring CosMx SMI：单细胞/亚细胞级6000靶点RNA成像

◆ 10x Genomics Xenium：靶向转录组原位分析（5KPanel,可补充480-2K基因的定制化检测）

◆ Akoya PhenoCycler-Fusion：100+蛋白标志物超高分辨率空间蛋白组

◆赛默飞Bigfoot全光谱超速分选仪：7激光55通道流式分选联动空间组学验证

◆实时单细胞多模态分析仪：检测组织器官内单细胞和亚细胞水平的分子表型和功能活性

◆活体成像转盘共聚焦显微镜：千帧/秒共聚焦记录空间动态过程

03|专业团队：跨学科融合创新

平台技术团队涵盖生物信息学、细胞生物学、分子生物学及病理学等领域，具备多年空间多组学技术实操经验，可根据客户的具体研究目标和样本特性，提供定制化的实验方案、技术路线优化与全流程质控服务，确保实验设计的科学性与数据的可靠性，并针对实验结果提供专业深入的个性化生物学解读与机制挖掘。可提供的服务如下所示：

◆空间组样本处理-数据采集-算法分析支持

◆多模态数据整合（空间转录组+蛋白组+病理学）分析

◆机器学习驱动空间表型挖掘（细胞通讯网络、生态位重构、疾病靶点定位）

◆跨尺度关联分析（分子空间分布→组织功能→宏观表型）

钱斌治

复旦大学人类表型组研究院 

教授，博士生导师

曾任英国爱丁堡大学癌症研究中心和生殖健康中心双聘终身教授。长期专注于肿瘤转移和免疫微环境的研究，阐明了巨噬细胞在癌症转移中的重要作用，并开创了转移相关巨噬细胞的研究领域。目前已在Nature、Cell、Nature Review Immunology等知名国际期刊发表了40余篇高水平学术论文，总引用超1万6千余次，累计影响因子334，其中9篇被web of science评为高被引文章，已转化国际发明一项，主持国际重大科研项目折合人民币超3000余万元。课题组在原有工作基础上，负责搭建了具有国际先进领先水平的复旦大学空间多组学测-算-控整合研究中心，将采用标准化研究，数据驱动，AI整合算法，功能验证四位一体的研究方式促进跨学科交叉融合，推动各相关研究领域的共同进步。